Protein–RNA interactions for Protein: Q14137

BOP1, Ribosome biogenesis protein BOP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOP1Q14137 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOP1Q14137 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOP1Q14137 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms