Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VEGFCP49767 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFCP49767 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms