Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO2P25791 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO2P25791 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO2P25791 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO2P25791 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO2P25791 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO2P25791 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO2P25791 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO2P25791 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO2P25791 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO2P25791 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO2P25791 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO2P25791 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO2P25791 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO2P25791 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO2P25791 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO2P25791 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO2P25791 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO2P25791 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO2P25791 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO2P25791 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO2P25791 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO2P25791 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO2P25791 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO2P25791 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO2P25791 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO2P25791 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO2P25791 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO2P25791 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO2P25791 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO2P25791 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO2P25791 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMO2P25791 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO2P25791 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO2P25791 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms