Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GLI4P10075 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GLI4P10075 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GLI4P10075 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GLI4P10075 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GLI4P10075 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GLI4P10075 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GLI4P10075 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GLI4P10075 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GLI4P10075 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GLI4P10075 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms