Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFLP07196 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFLP07196 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFLP07196 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFLP07196 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFLP07196 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFLP07196 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFLP07196 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFLP07196 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFLP07196 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFLP07196 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFLP07196 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFLP07196 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEFLP07196 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEFLP07196 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFLP07196 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFLP07196 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFLP07196 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFLP07196 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFLP07196 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFLP07196 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFLP07196 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFLP07196 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFLP07196 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFLP07196 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFLP07196 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFLP07196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFLP07196 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFLP07196 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFLP07196 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFLP07196 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFLP07196 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFLP07196 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFLP07196 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFLP07196 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFLP07196 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFLP07196 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFLP07196 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFLP07196 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFLP07196 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFLP07196 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFLP07196 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFLP07196 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFLP07196 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFLP07196 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFLP07196 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFLP07196 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFLP07196 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFLP07196 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFLP07196 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFLP07196 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFLP07196 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFLP07196 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFLP07196 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFLP07196 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFLP07196 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFLP07196 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFLP07196 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFLP07196 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFLP07196 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms