Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RASA4O43374 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASA4O43374 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RASA4O43374 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RASA4O43374 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASA4O43374 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASA4O43374 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASA4O43374 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASA4O43374 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASA4O43374 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASA4O43374 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASA4O43374 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms