Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms