Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM187AA6NFU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM187AA6NFU0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM187AA6NFU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms