Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI72

PRO0255, Putative uncharacterized protein PRO0255, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO0255Q9UI72 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0255Q9UI72 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRO0255Q9UI72 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms