Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDX25Q9UHL0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms