Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INPP4AQ96PE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
INPP4AQ96PE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INPP4AQ96PE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms