Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHLDB3Q6NSJ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHLDB3Q6NSJ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms