Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVEP1Q4LDE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVEP1Q4LDE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVEP1Q4LDE5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms