Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX2Q13950 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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