Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCGQ13326 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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