Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP1P59025 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP1P59025 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP1P59025 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP1P59025 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP1P59025 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP1P59025 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP1P59025 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP1P59025 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTP1P59025 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP1P59025 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP1P59025 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP1P59025 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP1P59025 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP1P59025 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms