Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADLP28330 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADLP28330 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADLP28330 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADLP28330 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADLP28330 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACADLP28330 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADLP28330 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADLP28330 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADLP28330 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADLP28330 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADLP28330 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADLP28330 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACADLP28330 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACADLP28330 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACADLP28330 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACADLP28330 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADLP28330 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADLP28330 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADLP28330 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADLP28330 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADLP28330 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADLP28330 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADLP28330 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADLP28330 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADLP28330 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms