Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB5P28074 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB5P28074 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms