Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DOAP06340 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HLA-DOAP06340 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HLA-DOAP06340 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms