Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFIT3O14879 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFIT3O14879 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFIT3O14879 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFIT3O14879 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms