Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQ87 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQ87 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQ87 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQ87 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQ87 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQ87 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQ87 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQ87 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQ87 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQ87 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQ87 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQ87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQ87 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
U3KQ87 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQ87 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQ87 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQ87 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms