Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms