Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRPC6Q9Y210 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms