Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG4Q9UBN1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms