Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWNKQ96RR1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWNKQ96RR1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWNKQ96RR1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms