Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFT1Q96AA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms