Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG1Q92597 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG1Q92597 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms