Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDHAF4Q5VUM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDHAF4Q5VUM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms