Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP2Q5T6F2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms