Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT12Q53H54 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms