Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ABCA2-212ENST00000464876 3438 ntTSL 213.55□□□□□ -0.248e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 INPPL1-203ENST00000535985 353 ntTSL 213.37□□□□□ -0.278e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SORBS3-204ENST00000517962 885 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.298e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.398e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 412.15□□□□□ -0.468e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CHTF8-206ENST00000519534 723 ntTSL 212□□□□□ -0.498e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.518e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GIT1-204ENST00000473217 3462 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.528e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.528e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.528e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.538e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.598e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 210.82□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.698e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 RAB3GAP2-203ENST00000462353 1906 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.768e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)3.78□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 32.8
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PCBP1Q15365 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.972e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-204ENST00000587597 2212 ntTSL 526.15■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PNPLA2-205ENST00000531923 637 ntTSL 225.3■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-207ENST00000461195 787 ntTSL 224.97■■□□□ 1.594e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 C2orf82-208ENST00000481155 660 ntTSL 324.38■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-218ENST00000587514 540 ntTSL 524.36■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-204ENST00000422344 631 ntTSL 324.31■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.464e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 KANSL1-214ENST00000576739 592 ntTSL 224.11■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 223.78■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CAPN1-220ENST00000530567 1415 ntTSL 223.51■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-203ENST00000394925 702 ntTSL 223.51■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC007388.1-202ENST00000443038 522 ntTSL 423.27■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PIK3R2-205ENST00000474310 425 ntTSL 323.27■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-219ENST00000604165 582 ntTSL 523.2■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC007388.1-203ENST00000422128 596 ntTSL 422.73■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 32.7
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