RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591286.5

RTN2-210, Transcript of reticulon 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RTN2, Length 2,111 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2-210ENST00000591286 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.81■■■■■ 6.85
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RTN2-210ENST00000591286 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.75■■■■■ 5.23
RTN2-210ENST00000591286 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.72■■■■■ 5.23
RTN2-210ENST00000591286 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.62■■■■■ 5.21
RTN2-210ENST00000591286 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.93■■■■■ 5.1
RTN2-210ENST00000591286 ABCC9O60706 1549 aa46.88■■■■■ 5.1
RTN2-210ENST00000591286 NACADO15069 1562 aa46.48■■■■■ 5.03
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RTN2-210ENST00000591286 SCRIBQ14160 1630 aa46.21■■■■■ 4.99
RTN2-210ENST00000591286 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.93■■■■■ 4.94
RTN2-210ENST00000591286 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
RTN2-210ENST00000591286 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.08■■■■■ 4.81
RTN2-210ENST00000591286 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.95■■■■■ 4.79
RTN2-210ENST00000591286 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.73■■■■■ 4.75
RTN2-210ENST00000591286 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.61■■■■■ 4.73
RTN2-210ENST00000591286 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
RTN2-210ENST00000591286 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.56■■■■■ 4.72
RTN2-210ENST00000591286 WIZO95785 1651 aa44.4■■■■■ 4.7
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RTN2-210ENST00000591286 SMARCA4P51532 1647 aa44.3■■■■■ 4.68
RTN2-210ENST00000591286 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
RTN2-210ENST00000591286 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.71■■■■■ 4.59
RTN2-210ENST00000591286 SMARCA2P51531 1590 aa43.54■■■■■ 4.56
RTN2-210ENST00000591286 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.52■■■■■ 4.56
RTN2-210ENST00000591286 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
RTN2-210ENST00000591286 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.44■■■■■ 4.54
RTN2-210ENST00000591286 TRIM41Q8WV44 630 aa43.36■■■■■ 4.53
RTN2-210ENST00000591286 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
RTN2-210ENST00000591286 NCAPD3P42695 1498 aa42.93■■■■■ 4.46
RTN2-210ENST00000591286 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.92■■■■■ 4.46
RTN2-210ENST00000591286 HMGXB3Q12766 1538 aa42.9■■■■■ 4.46
RTN2-210ENST00000591286 ABCC8Q09428 1581 aa42.83■■■■■ 4.45
RTN2-210ENST00000591286 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
RTN2-210ENST00000591286 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.38
RTN2-210ENST00000591286 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.4■■■■■ 4.38
RTN2-210ENST00000591286 SYNJ1O43426 1573 aa42.26■■■■■ 4.36
RTN2-210ENST00000591286 SOGA1O94964 1423 aa42.17■■■■■ 4.34
RTN2-210ENST00000591286 CFTRP13569 1480 aa42.17■■■■■ 4.34
RTN2-210ENST00000591286 EEA1Q15075 1411 aa42.12■■■■■ 4.33
RTN2-210ENST00000591286 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.06■■■■■ 4.32
RTN2-210ENST00000591286 TOP2BQ02880 1626 aa42■■■■■ 4.31
RTN2-210ENST00000591286 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.99■■■■■ 4.31
RTN2-210ENST00000591286 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.93■■■■■ 4.3
RTN2-210ENST00000591286 PRDM2Q13029 1718 aa41.92■■■■■ 4.3
RTN2-210ENST00000591286 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.89■■■■■ 4.3
RTN2-210ENST00000591286 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.89■■■■■ 4.3
RTN2-210ENST00000591286 CUX1P39880 1505 aa41.78■■■■■ 4.28
RTN2-210ENST00000591286 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.61■■■■■ 4.25
RTN2-210ENST00000591286 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.6■■■■■ 4.25
RTN2-210ENST00000591286 GOLGA3Q08378 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
RTN2-210ENST00000591286 KIF21BO75037 1637 aa41.56■■■■■ 4.24
RTN2-210ENST00000591286 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.53■■■■■ 4.24
RTN2-210ENST00000591286 CEP162Q5TB80 1403 aa41.45■■■■■ 4.23
RTN2-210ENST00000591286 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.44■■■■■ 4.23
RTN2-210ENST00000591286 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
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RTN2-210ENST00000591286 NESP48681 1621 aa41.38■■■■■ 4.21
RTN2-210ENST00000591286 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.33■■■■■ 4.21
RTN2-210ENST00000591286 KIF27Q86VH2 1401 aa41.3■■■■■ 4.2
RTN2-210ENST00000591286 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.27■■■■■ 4.2
RTN2-210ENST00000591286 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.27■■■■■ 4.2
RTN2-210ENST00000591286 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.22■■■■■ 4.19
RTN2-210ENST00000591286 PRXQ9BXM0 1461 aa41.2■■■■■ 4.19
RTN2-210ENST00000591286 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.16■■■■■ 4.18
RTN2-210ENST00000591286 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.16■■■■■ 4.18
RTN2-210ENST00000591286 CUX2O14529 1486 aa41.08■■■■■ 4.17
RTN2-210ENST00000591286 TOPBP1Q92547 1522 aa41.07■■■■■ 4.17
RTN2-210ENST00000591286 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.01■■■■■ 4.16
RTN2-210ENST00000591286 CLIP1P30622 1438 aa40.98■■■■■ 4.15
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RTN2-210ENST00000591286 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.83■■■■■ 4.13
RTN2-210ENST00000591286 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.83■■■■■ 4.13
RTN2-210ENST00000591286 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.71■■■■■ 4.11
RTN2-210ENST00000591286 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.7■■■■■ 4.11
RTN2-210ENST00000591286 WDR97A6NE52 1622 aa40.63■■■■■ 4.1
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RTN2-210ENST00000591286 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.45■■■■■ 4.07
RTN2-210ENST00000591286 CUL7Q14999 1698 aa40.45■■■■■ 4.07
RTN2-210ENST00000591286 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
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RTN2-210ENST00000591286 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.1■■■■■ 4.01
RTN2-210ENST00000591286 ERCC6Q03468 1493 aa40.09■■■■■ 4.01
RTN2-210ENST00000591286 IFT140Q96RY7 1462 aa40.07■■■■■ 4
RTN2-210ENST00000591286 PBRM1Q86U86 1689 aa40.04■■■■■ 4
RTN2-210ENST00000591286 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
RTN2-210ENST00000591286 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 4
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