Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF2Q12772 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF2Q12772 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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