Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSFA2P28290 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1224.2 ms