Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRAP19793 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RXRAP19793 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RXRAP19793 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RXRAP19793 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RXRAP19793 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRAP19793 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRAP19793 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRAP19793 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRAP19793 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRAP19793 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RXRAP19793 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RXRAP19793 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RXRAP19793 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RXRAP19793 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RXRAP19793 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RXRAP19793 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RXRAP19793 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RXRAP19793 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RXRAP19793 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RXRAP19793 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RXRAP19793 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RXRAP19793 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms