Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT3O95395 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCNT3O95395 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT3O95395 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms