Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U3KQA8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U3KQA8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U3KQA8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U3KQA8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U3KQA8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQA8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQA8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQA8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQA8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQA8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQA8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQA8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQA8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQA8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQA8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQA8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQA8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQA8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQA8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQA8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQA8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
U3KQA8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U3KQA8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQA8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQA8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQA8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQA8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQA8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQA8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQA8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQA8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQA8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQA8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQA8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms