Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSAQ9Y285 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSAQ9Y285 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSAQ9Y285 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms