Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS3Q9UPU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms