Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms