Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC40A1Q9NP59 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms