Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms