Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1Q6P1K2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMF1Q6P1K2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMF1Q6P1K2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms