Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDHAF4Q5VUM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHAF4Q5VUM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms