Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC27Q2M243 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC27Q2M243 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms