Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHROOM2Q13796 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHROOM2Q13796 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SHROOM2Q13796 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
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