Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C1Q12789 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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