Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFF3Q07654 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFF3Q07654 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms