Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP1P59025 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP1P59025 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP1P59025 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP1P59025 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP1P59025 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP1P59025 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP1P59025 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP1P59025 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP1P59025 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP1P59025 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTP1P59025 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RTP1P59025 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP1P59025 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTP1P59025 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP1P59025 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP1P59025 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP1P59025 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP1P59025 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP1P59025 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP1P59025 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP1P59025 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP1P59025 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP1P59025 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP1P59025 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP1P59025 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP1P59025 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP1P59025 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP1P59025 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP1P59025 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTP1P59025 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTP1P59025 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP1P59025 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP1P59025 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP1P59025 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP1P59025 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP1P59025 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP1P59025 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP1P59025 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP1P59025 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP1P59025 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP1P59025 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP1P59025 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP1P59025 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP1P59025 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RTP1P59025 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms