Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms